Predição de função de proteínas através da extração de características físico-químicas

Authors

  • Thiago Assis de Oliveira Rodrigues PUC MINAS
  • Larissa Fernandes Leijôto PUC MINAS
  • Poliane C. Oliveira Brandão
  • Cristiane Neri Nobre Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais

DOI:

https://doi.org/10.22456/2175-2745.49242

Abstract

Com a conclusão do projeto Genoma, o número de novas proteínas descobertas tem crescido, mas devido ao alto custo e da demora dos processos de descoberta da função de proteínas, apenas uma pequena parcela das mesmas tem sua função conhecida. Este trabalho apresenta uma metodologia para predição de função de proteínas através da extração de características de suas estruturas, presentes no banco de dados StingDB, a utilização da Transformada Discreta do Cosseno, a codificação da estrutura primária, o balanceamento de classes e a utilização de Máquinas de Vetores de Suporte. Os valores médios obtidos para a precisão, sensibilidade, acurácia e especificidade foram, respectivamente de 80\%, 71%, 74% e 77%. Os resultados foram comparados com outros trabalhos da literatura, e mostraram um aumento de 10% na taxa de precisão.

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Author Biography

Cristiane Neri Nobre, Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais

Departamento de Ciência da Computação

PosGraduação em Informática

Pontifícia Universidade Católica de Minas Gerais

Published

2015-05-04

How to Cite

de Oliveira Rodrigues, T. A., Leijôto, L. F., Brandão, P. C. O., & Nobre, C. N. (2015). Predição de função de proteínas através da extração de características físico-químicas. Revista De Informática Teórica E Aplicada, 22(1), 29–51. https://doi.org/10.22456/2175-2745.49242

Issue

Section

Regular Papers